En cuanto a las causas de esta falta de nacimiento de las piezas dentales, está asociada a factores genéticos; de hecho, el componente hereditario influye en la agenesia dental. Por ello, es bastante común que varios miembros de la familia cuenten con este problema congénito, al igual que sucede con otro tipo de enfermedades.
Además, cuando hay alguna alteración sistémica es bastante probable que se produzcan agenesias dentales. Igualmente, las personas que tienen alguna alteración cromosómica como el síndrome de Down o una deformación congénita como la fisura labiopalatina también son más propensos a padecer agenesias dentales.
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